Η διάρκεια της ψυχαναλυτικής ψυχοθεραπείας εξαρτάται από τις δυσκολίες που αντιμετωπίζει ο θεραπευόμενος. Στις περισσότερο βραχυπρόθεσμες παρεμβάσεις, η ψυχαναλυτική ψυχοθεραπεία διαρκεί από μερικές εβδομάδες εώς μερικούς μήνες με συχνότητα θεραπείας μία εώς δύο φορές την εβδομάδα. Σε άλλες περιπτώσεις, είτε γιατί υπάρχουν σημαντικές συναισθηματικές δυσκολίες, είτε γιατί ο θεραπευόμενος επιθυμεί να κατανοήσει καλύτερα τον εαυτό του, συνίσταται μακρά ψυχαναλυτική ψυχοθεραπεία η οποία μπορεί να διαρκέσει εώς αρκετά χρόνια και η συχνότητα θεραπείας μπορεί να κυμαίνεται από 1 εώς 3 φορές την εβδομάδα.
